- Collezione di Chimica "Giacomo Ciamician"
- MEUS - Museo Europeo degli Studenti
- Museo della Specola
- Museo delle Cere anatomiche "L. Cattaneo"
- Museo di Anatomia Comparata
- Museo di Anatomia degli Animali Domestici
- Museo di Anatomia Patologica e Teratologia Veterinaria
- Museo di Antropologia
- Museo di Fisica
- Museo di Mineralogia "Luigi Bombicci"
- Museo di Palazzo Poggi
- Museo di Zoologia
- Museo Geologico "Giovanni Capellini"
- Orto Botanico ed Erbario
